大家好呀!今天小编和大家分享的是年4月发表在杂志FrontiersinOncology(IF=6.)上的一篇文章,题目为:脑胶质瘤基质细胞GASCs通过调控肿瘤免疫微环境刺激脑胶质瘤恶化。
DOI:10./fonc..
摘要
脑胶质瘤基质细胞(Glioma-AssociatedStromalCell,GASC)是一个最近发现的,存在于脑胶质瘤微环境中的细胞类型,可能是脑胶质瘤的预后标志物。然而,在脑胶质瘤微环境中GASCs的潜在作用机制很大程度上仍是未知的。本研究中,我们主要是探究GASCs在脑胶质瘤中的作用机制,尤其是高级别脑胶质瘤(High-GradeGlioma,HGG)。
我们基于从TCGA和CGGA数据库下载的脑胶质瘤数据集,使用单样本基因集富集分析(Single-sampleGeneSetEnrichmentAnalysis,ssGSEA)算法将样本数据划分为high-、low-GASC组。使用xCELL和CIBERSORT算法分析基质细胞和免疫细胞的组成。基于风险得分和列线图模型预测脑胶质瘤的预后。
我们首次观察到在High-GASC组中M2巨噬细胞和免疫检查点(PD-1、PD-L1、PD-L2、TIM3、Galectin-9、CTLA-4、CD80、CD86、CD、CIITA)水平显著升高,并与全部脑胶质瘤样本和HGG样本的GASC得分呈正相关。DR3和CIITA拷贝数变异在High-GASC组较高。THY1(一种GASC标志物)在High-GASC组中甲基化程度较低。风险评分是脑胶质瘤预后的独立预测因子。最后,本研究基于风险评分构建列线图预测模型。
GASCs通过M2巨噬细胞刺激恶性脑胶质瘤恶化,并与肿瘤微环境中的免疫检查点水平相关。THY1的甲基化可作为脑胶质瘤的预后指标和治疗靶点,但研究结果仍需要进一步验证。
技术路线
材料与方法
1.数据集使用公共数据库:肿瘤基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA,