万字长文解析m6A及非编码RNA与肿瘤干

转载自:生信人

Theinterplaybetweenm6AmodificationandnoncodingRNAincancerstemnessmodulation:mechanisms,signalingpathways,andclinicalimplicationsm6A修饰和非编码RNA在肿瘤干性调节中的关系:机制、通路及临床意义m6A、ncRNA以及肿瘤干性今年来的研究热度不断上升,作者根据最新的研究进展将三者间的相互作用关系进行了综述。文章内容较多,为便于阅读,本文相较于原文有所删减和调整。即便如此,篇幅依然较长,小伙伴们可以按需、按兴趣选择性阅读相应部分。摘要:肿瘤干性在肿瘤进展中发挥重要作用,是近年来肿瘤研究中的热点之一,是导致放化疗耐受、肿瘤发生、转移、自我复制、代谢重编程以及免疫微环境改变的重要原因。但是具体的机制尚不清楚。大量的研究表明ncRNA在肿瘤干性的调节中起到重要的作用。m6A修饰对于RNA(包括ncRNA)发挥生物功能,包括RNA的剪接、稳定、翻译、降解和输出等方面,具有重要的意义。证据表明m6A可以控制ncRNA的表达和功能,从而调控肿瘤干性。但是肿瘤干性调控中的ncRNA和m6A的关系却极少研究,这篇综述介绍了近期关于m6A、ncRNA和肿瘤干性相关的研究和发现。通过对Wnt/β-catenin、MAPK、Hippo以及JAK/STAT3等通路的研究,试图寻找m6A和ncRNA在肿瘤干性中潜在的交互作用机制。值得指出的是ncRNA和m6A修饰分子潜在的临床价值,在众多癌种中具备作为肿瘤干性标志物、治疗靶点的潜力并有助于提高诊断的准确性。关键词:N6-甲基腺苷(m6A)修饰,非编码RNA(ncRNA),肿瘤干性,信号通路,生物标志物1、介绍N6-甲基腺苷(m6A)是真核mRNA中最普遍的修饰,调节RNA稳定性,剪接,降解,翻译和输出等。m6A修饰的功能受三个同源因子的控制,包括“writers”,“readers”和“erasers”。m6A“writers”:可以催化RNA上腺苷的m6A修饰,主要包括甲基转移酶样3蛋白(METTl3),甲基转移酶样14蛋白(METTl14)和WT1相关蛋白(WTAP)。m6A“writers”还含有RNA结合域蛋白15/15B(RBM15/15B),甲基转移酶样16(METTL16),含锌指CCCH型13(ZC3H13),以及Vir样m6A甲基转移酶(VIRMA,又称KIAA)等等。m6A“erasers”:主要包括FTO和ALKBH5。这些蛋白质可以从RNA中除去甲基化,这意味着m6A修饰是动态和可逆的。m6A“readers”:选择性RNA结合蛋白,其可以识别m6A,其主要包括含YT-B同源性(YTH)结构域蛋白家族(包括YTHDF1/2/3等YTHDFs,以及YTHDC1/2等YTHDCs)。另外的reader包括胰岛素样生长因子-2mRNA结合蛋白(包括IGF2BP1/2/3的IGF2BPs),不均一核糖核蛋白(HNRNP)家族(包括HNRNPA2B1,HNRNPC和HNRNPG)和NF-κB-相关蛋白(NKAP)和真核转换起始因子3(eIF3)(图1)。m6A修饰富集于共识序列RRACH(其中R:A或G和H:A,C或U)和3未翻译区域(3-UTR),终止密码子以及内部的长外显子。图1非编码RNA通常缺乏对蛋白质进行编码的能力,在本综述中,我们主要


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